主张将齐泰、黄子澄等大臣绑缚送交敌营的，本来就心虚，自不敢多言；主张退避的，恐怕真个被方孝孺料中——千里逃亡，无有终日，自不敢多言；那些不表意见的人，多是力主削藩，但由于战事失利，祸及京师，怕皇帝降罪，自也都不敢多言。
全场里就只有方孝孺的声音。建文帝知道，自己只好、也只能听从——国事如此，唯直臣可倚了。幸好刑部尚书暴昭此时站出来，声明支持方孝孺的意见，那些一时之间持观望态度的大臣这才忙不迭的随声附和。
主张既定，那么首先要做的便是将城外未曾逃走的居民迁入，坚壁清野，不让叛军在附近找到粮食、抓到壮丁。其次就是封城，选派将领，调出五都督府衙的军队分守京都九门，全城戒严，不准闲杂人等出入城门，以免叛军探子混入刺探虚实或内贼与外匪互通消息，里应外合。
这其中，以面北的金川门、中华门、康顺门最据要冲，直撄叛军兵锋。须得选派最重要的将领据守。
时在京中，能征善战、立有显赫战功的不过二人。
一是长兴侯耿炳文
，此人早年随太祖攻打陈友谅，前后数十战，无一败迹，堪称元功宿将中的硕果仅存。在燕军初叛时曾被拜为平燕大将军，领十三万南军与叛军战于真定，不幸初战失利，只能退守，不能冲锋。建文帝急于削藩安天下，闻其战而无功，非常不满，便将他召回京师，以颇负虚名的李景隆替之，