闲山岛海战的战果被朝鲜人无限放大，绝大多数朝鲜人包括官方认为此战使日军彻底失去制海权，但实际上，日本水师只是丧失了部分制海权。
但客观的说，经此一役，日军运送军粮等补给变得更加艰难，严重迟滞了陆军接下来的进攻计划，迫使敌陆军在占领平壤后却步不前，让朝鲜军民大大喘了一口粗气，也给明军入朝创造了一定的时间上的缓冲，甚至可以说，给沈惟敬和日本的谈判也增加了筹码。
当消息传到大阪天守阁时，秀吉并没有发火，终究是长叹一声，此时他也早收到秀家的来信，事实已经证明有些事确实是急不得，豪赌不可能每次都如人所愿的，秀家赌对了，日军上了岸，而秀吉这次却赌错了，水军败了，败得很彻底。
如同抗战中日军从开始的三个月灭亡中国后来发现实现不了又变成步步蚕食一样，经过深思熟虑，秀吉也终于决定，改变计划，令日本军于朝鲜南端建筑倭城以作防备和储粮之用，水军既然难堪大用，那就水陆配合，改为防御作战，同意秀家的方案，不与朝鲜水军正面交战，而是吸引朝鲜水军登陆后再与之接战。
改变战术的日军在随后面对朝鲜水军时的确收获奇效，真实的李舜臣也并未像朝鲜人所吹嘘的战无不胜，这一次他就昏了头脑，他以将在外君命有所不受的理由拒绝了朝鲜王让其进攻日军补给线的命令，转而企图进攻釜山，连战连捷的他试图一举攻占日本水军大本营，但被日军击败，攻占釜山的计划失败直接致使朝鲜水师将领郑运阵亡。到了11月，在长门浦海战中，李舜臣再次进攻日军基地，又被日军击败，其陆上进攻部队遭到很大损失。在后续海战中，李舜臣先后在熊浦、唐项浦和永登浦的攻击均被日军击退。也为日后李舜臣被清算埋下了伏笔。
接二连三的失利，也让李舜臣如同受伤的小猫不得不收缩回港口舔舐伤口恢复原气，此时的他清醒了很多，朝鲜军的短处是只要涉及到登陆作战，就难以取得胜利，他也在思索下一步要怎么办…
在李舜臣于水上取得一系列胜利之时，日本的陆军也没闲着而是进攻了当时在名义上还臣属于明朝的兀良哈建州女真部。其主将加藤清正也成为了日本历史上第一个进攻中国本土的将军…
自与秀家和小西于汉城分别后，加藤清正便率领日本第二军团攻略咸镜道，在7月初，部队以少胜多战胜咸镜北道兵马节度使韩克诚率领的大军，也获得了意外之喜，那就是在追击过程中将朝鲜的两位王子临海君与顺和君逮了个正着，看着吓的呆目的两个小鲜肉，他并未加害反而奉为上宾，以礼相待。还说出来那段在日本至今传颂的名言:“我日本国乃是仁义之邦，富有仁爱之心，从来不妄杀投降者......”
这话就与后来的那句“中日友好，共创大东亚共荣圈”一般虚伪，取得胜利后，加藤清正便兵锋直入中国东北。
七月中，加藤清正率军越过豆满江（图门江），进攻兀良哈建州女真部。此时的建州女真统领努尔哈赤并不在当地，而是正带兵与海西女真各部作战，根本不知道自己的大后方被日本军侵入。
首次大战，加藤清正斩敌九百人，攻破其都城。就在日本军洋洋得意之时，令他们没有想到，女真部落又返回来了。虽然海西女真跟建州女真常年不合，但这一次，海西女真却帮了建州女真一把，他们迅速集结，不论老幼凡是能骑马的骑上战马，凡是能射箭的都拿起弓箭，直奔加藤清正营盘，并将其包围，并反复进行攻击。
加藤清正的日本军无法抵御，只能放弃一切向朝鲜方向突围，返回咸镜道内地。虽然最终一无所获，但无论如何，加藤清正也是唯一对明作战期间踏上明国土地的大名了。
就在朝鲜山河动摇之际，大明的天下也开始动荡不安。
如今京营不复从前，早已无战斗力，180万的明军也只是存在在兵部官文上，卫所制度和唐朝中后期的府兵制一样已经崩溃，各地缺额普遍，军户更是年年逃跑。自戚继光起，雇佣兵在战场上的比重越来越大，雇佣兵才真正的存在了些战斗力，这些雇佣兵随主将出生入死也得到了几倍于卫所兵的收入，但在朝廷看来这是私兵是家将，不能不用又不能重用，所以李如松这些将领的一言一行，都十分小心。与此同时，李如枫发现