世界末日已经过去三年了，中亚和非洲的大部分地下城相继陷落，伤亡惨重。不过，各个地下城交通和通讯断绝，其他城都不知道这种情况，只有凌子寒和卫天宇的元神曾经在外星侵略者的飞船上亲眼见到，才能推测出来。
最近半年来，地球表面的那些诡异物质渐渐消失，天空中的厚厚粉尘慢慢落下。阳光重新普照大地，全球气温逐渐升高，堆积在各个大陆上的冰山开始消融，洪水再一次洗劫大地。以前的各种污染全部消失，被现代科技严重破坏的资源在逐步恢复，南北极上空的臭氧空洞也在弥合。荒芜的地表上有了新绿，江河湖海也变得清澈见底。
地球似乎正在往好的方向发展，但是在地下城生活的人们大多并不清楚。他们已经习惯了安定而规律的日子，不再有恐惧。
亚洲东部的九宫城核心区有一大片科研机构，全部都在研究凌子寒和卫天宇从外星人飞船带回的资料。
凌子寒的身体已经确认得到全面进化，衰老基因几乎消失，精神力无比强大，身体细胞也“返老还童”，几乎是相当于婴儿般的“先天”状态。他现在非常年轻英俊，精力旺盛，记忆力、理解力比以前增强数倍。因为强大，所以无畏，他的气质更加内敛温和，仿佛完全无害，只有了解他的极少数人才明白他的可怕。
童阅率领的专家组根据医院检测数据评估，他的状态正趋向传说中的“神明”，健康、长寿、睿智、强大。根据他的变化，童阅领导的课题组开始研究“长寿药剂”，让人类延长寿命已不是梦想。
卫天宇的脑域也得到极大开发，由他领导并实际参与智能系统、全息网络、宇宙能源、曲率飞行、航天科技、机甲研发、太空武器等相关项目的研究。卫家老少三代都参与其中，只有卫天宇的大哥卫天穹领导地外生命研究所，负责研究外星人和外星数据库中存储的所有宇宙生物。
凌子寒和卫天宇的脑波离奇去往太空，潜入外星人的飞船，将他们数据库中的无数资料带回来，至今已经过去两年了。
两年来，九宫城集中了能够找到的所有语言学家和拥有绝佳语言天赋的各种人员，全力研究外星语