朱由校原本以为这一万万债券至少要半年才能卖完，甚至做好了卖不完的准备的，想不到竟然如此快速就卖光了。看来这大明的民间，有钱得出乎他的意料呀。其实并不需要发行债券，银行便可以提供足够的钱来修建公路，但毕自严担心通货膨胀的问题，建议将天下钱币收一部分回来，以免出现物价飞涨的情况。
毕自严见债券如此好卖，便提议继续发行第二期和第三期债券，朱由校不同意。并不是必须的情况下，还是少发一些债券的好。
京山铁路试运行一个月后，便开始了正式运行。京山铁路共有宛平，通州，宝坻，丰润，卢龙，抚宁，山海关，八里铺共八个车站（原有的拱极城是军站，民用不经过拱极站）。铁路是双线，这是朱由校决定的，他可不想以后再去单线改双线，现在只有货车。
从宛平到山海关共有六百多里路，按现在火车的运行速度（考虑地形问题，平均算大约是每小时四十里），大约需要十五个小时。这对于常年奔波在这条路上的商人们来说，这样的速度简直是不可想象的，原来要走十几天的路，现在一天不到就能完成，这中间节约的时间以及住店，吃饭的消费大为减少，还大大增加了资金的流动性。
所以虽然火车运货所需要的费用较高，而且车站专门有税务局按货物价值来收税，一般的商人都会选择用火车来运送货物。原来一些容易变质的货物象海鲜，只有在冬天才能运送或者腌制后才能运送，现在都没有了这个顾虑，只要你肯花钱，甚至可以连鱼带水的一起运送到京城，下车的时候，鱼还是活蹦乱跳的。
大量的运送请求发给了京山铁路局，因为数量太多，商人们便开始预定某一天的运输车皮，现在已经排到了三个月以后。当然这是按试运行时的速度来计算的，试运行一个月后，京山铁路局积累了大量的运送经验，而兵器局又建造了更多的车头和车皮，双线的优势终于得到了体现，据魏忠贤收到的报告，现有的三个月运送量，可以在两个月内就完成。
铁路运输的火爆，使得两京线（北京到南京）和山木线（山海关到木古河卫）的修建工作很快就提上了日程。朝廷成立了大明铁路部，由茅元仪任铁路部尚书，这样大明的六部便变成了八部，而茅元仪一个没有功名的年轻人竟然一跃而成一部尚书，这让人们极为吃惊。京师大学堂的学生们一个个羡慕不已，却也从茅元仪身上看到了自己日后奋斗可能达到的地步。至于被赶回南方的邹元标等人，则酸溜溜地认为，如此下去，必然会导致国将不国也。
茅元仪上任之初，便于铁道部成立了清吏司，建造司，勘察司，损补司。分别负责铁路安全监查，修筑铁路，勘察路线，赔偿沿路的损失。而朱由校抽调了东厂和锦衣卫的人手，专门成立了一个铁路统计局，负责与铁路有关的贪污腐败行为。
天启七年十月，两京线的勘察已经完成，铁道部上报给内阁后，内阁提请皇帝御览。朱由校指示道:“修好，不要急，按一百年的标准来修。”
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