给起了一个名字，称之为：“汝南营”，何仪所带之九百人是“汝南左营”，许仲、刘邓、原盼等所带之一千人是“汝南右营”。从此之后，荀贞麾下就有三营，可分为三军使用了，中军自然就是他的本部，左右两军即是汝南左右营。
在接到皇甫嵩令整编、集训的将令后，他整日泡在营中，又把汝南左右营的编制细化了一下。
他手头可用的人不多，虽有大批的西乡轻侠、里民，可这些都是他的本部基础、骨干力量，不可能全部调到汝南左右营里去。中军，也即本部的作战力量是第一位的，与其使这三部人马战力平均，不如优先保持本部的可靠和战力。故此，他从本部中没有抽调太多的人，只抽调了数十人，并把这数十人全部编入了汝南右营，以加强许仲、刘邓、原盼等对汝南右营的掌控力，而对汝南左营，他一个人也没放进去，全凭何仪自己安排编制。
经过细化编制，他部下这三千人就形成了这样一个局面：中军是骨干，忠诚可靠，战力最强，右军次之，不能保证非常忠诚，但至少可以掌控住，左军再次之，忠诚和战力全得看何仪。
这样的编制看似是放任了何仪，实际上却是眼下唯一、也是最好的选择，即所谓之“强干弱枝”，正是光武皇帝中兴汉室之后，以重驭轻，用中央禁军来驾驭天下郡国军的办法。
中军可靠，战力强，军械也是最好的，有这样一支力量在手，即便何仪万一叛乱也不足忧。许仲、刘邓、原盼能够掌控住右军，这千人就算跟着生乱也会有个缓冲的时间，一千二百人的中军力量，完全可以在这段时间里将何仪的叛乱扑灭。
事实上，“何仪叛乱”这只是最坏的假设。皇甫嵩天下名将，他既然做出了收容、改编黄巾俘虏的决定，就说明他有足够的把握可以保证这些俘虏不会生乱。
原因很简单：汝南郡很大，三十七个县，两百多万人口，这一方面使得汝南黄巾人多势众，人数远多於颍川黄巾，另一方面却也使得汝南黄巾内部派系林立，山头亦远多於颍川黄巾。有派系，有山头，彼此就有矛盾，有矛盾就可以利用。皇甫嵩收编的这些黄巾俘虏都是经过仔细选择的，没有一个太平道的坚贞信徒，多半是浑水摸鱼之徒，而他拨给荀贞的这两千俘虏更是大多为彭脱、龚都等人的旧部，很少有何仪的旧部。黄巾渠帅的部众大多是自己的乡人，彭脱、龚都、何仪不是一个地方的人，何仪对彭脱、龚都的部众并不熟悉，彭脱、龚都的部众也不熟悉他，这样一来，就不必担忧他们马上就能抱成团。
只要他们没有马上抱成团，以荀贞的手段，就有足够的信心分化、拉拢他们。俘虏中有不少原本的黄巾小帅，在这几天的整编、集训中，荀贞对这些人大力笼络，又把他“推衣衣之，推食食之，同榻眠之”的手段拿出，摆酒宴请，小处关心，并向他们许诺，只要他们尽忠作战，不生二心，皇甫嵩必会上书朝廷赦免他们的罪过，并许诺只要他们立下战功，该赏钱就赏钱，该赏官就赏官。
这些小帅们本非太平道信徒，之所以兴起从乱，原因和何仪一样，不过是贪求财货女子，而今战败被俘，能不死已是万幸大喜，又得了荀贞如此推心置腹的对待，并得到许诺，便是最先有些不安的也渐渐地放下了心。
荀攸、戏志才又示意许仲、刘邓、原盼等人在平时装作不经意的样子，多说一些荀贞以往的事迹、战功，并及荀贞的一诺千金，言而有信和他在颍川的名望。
双管齐下，在皇甫嵩、朱俊决定拔营出发前，这两千拨给荀贞的汝南黄巾俘虏不敢说全部归心於荀贞了，至少六成以上都安心的待在军中，没有狐疑不定的情况了。人心这个东西，只要一定下来，不复狐疑惊恐，再去煽动他们作乱就难了。
经过五天的整编、集训，传旨的宦官一再催促，皇甫嵩、朱俊不再耽误，四月二十五这一天，两人各至营中，集合本部，鼓角齐鸣，旗矛交错，全军数万人离营出寨。
朱俊去荆州南阳，出平舆后向南走，经阳安、郎陵，行百余里即是南阳郡界。皇甫嵩去兖州东郡，出平舆后向北边去，路途就远了，需先经过陈国，再经过陈留郡，之后才是东郡，全程大约五百里，陈国、陈留两郡内没有大股的黄巾军活动，可也有小股的盗贼，这一路上又要行军，又要剿贼，将会是一段